简单的非丝带和弦图（Python 2.7）

Question

我希望复制一个与此类似的情节： 符合以下标准：

• 点之间的非带状连接（细线）
• 每个点外的文字
• 只有 10 点左右，而不是上面显示的 30+。
• 不需要额外的颜色（线条/文本）。

我知道有像 Plotly 这样的包，但这些包似乎专用于具有带状连接，而不是事物线。我也知道Circos，但似乎很难做出相对简单的东西。

有一个我可以使用的直接的 Python 2.7 脚本（在线示例或在线工具）吗？

Answer 1

我也想知道如何制作这样的图表。

我还在谷歌图片上搜索了你的图片，发现了一些带有这样的视觉效果的论文，但没有说明他们是如何制作的。

我还问了 chatGDP，这是它给我的：

import matplotlib.pyplot as plt
import networkx as nx
import pandas as pd
import numpy as np

# Example data
edges = [
    ('KP1513', 'GP1521'), ('KP1513', 'GP2243'), ('KP1412', 'GP1521'), 
    ('GP641', 'GP913'), ('GP5979', 'KP1070'), ('GP5056', 'GP1034'), 
    ('GP4715', 'KP730'), ('GP4263', 'KP748'), ('GP4217', 'KP993'), 
    ('GP4123', 'GP1132'), ('GP4007', 'GP3040'), ('GP2876', 'GP408'), 
    ('KP808', 'GP555'), ('KP808', 'GP5881'), ('KP808', 'GP5930'), 
    ('KP808', 'GP6291'), ('KP651', 'KP1789'), ('KP651', 'KP905'), 
    ('KP651', 'KP579'), ('KP651', 'KP682'), ('KP815', 'KP905'), 
    ('KP815', 'KP1933'), ('KP815', 'KP1789'), ('KP815', 'KP579'), 
    ('KP1988', 'GP4263'), ('KP1988', 'GP4217'), ('KP1988', 'GP4123'), 
    ('KP1988', 'GP4007')
]

# Create a graph
G = nx.Graph()
G.add_edges_from(edges)

# Assign groups to nodes
group_assignments = {
    'KP1513': 'blue', 'KP1412': 'blue', 'GP641': 'blue', 'GP5979': 'blue', 'GP5056': 'blue',
    'GP4715': 'red', 'GP4263': 'red', 'GP4217': 'red', 'GP4123': 'red', 'GP4007': 'red', 
    'GP2876': 'yellow', 'KP808': 'yellow', 'KP651': 'yellow', 'KP815': 'yellow', 'KP1988': 'yellow',
    'GP1521': 'orange', 'GP2243': 'orange', 'GP913': 'orange', 'KP1070': 'orange', 'GP1034': 'orange', 
    'KP730': 'green', 'KP748': 'green', 'KP993': 'green', 'GP1132': 'green', 'GP3040': 'green', 
    'GP408': 'purple', 'GP555': 'purple', 'GP5881': 'purple', 'GP5930': 'purple', 'GP6291': 'purple',
    'KP1789': 'pink', 'KP905': 'pink', 'KP579': 'pink', 'KP682': 'pink', 'KP1933': 'pink'
}

# Assign node colors based on groups
node_colors = [group_assignments[node] for node in G.nodes]

# Create circular layout with grouped nodes
def grouped_circular_layout(G, group_assignments):
    groups = {}
    for node, group in group_assignments.items():
        if group not in groups:
            groups[group] = []
        groups[group].append(node)

    pos = {}
    angle_step = 2 * np.pi / len(G.nodes)
    current_angle = 0

    for group_nodes in groups.values():
        for node in group_nodes:
            pos[node] = (np.cos(current_angle), np.sin(current_angle))
            current_angle += angle_step

    return pos

pos = grouped_circular_layout(G, group_assignments)

# Draw the graph
plt.figure(figsize=(12, 12))
nx.draw(G, pos, with_labels=True, node_size=700, node_color=node_colors, edge_color='gray', linewidths=1.5, font_size=10, font_color='black', font_weight='bold')
plt.title("Chord Diagram with Grouped and Color-Coded Nodes")
plt.show()