当我从网上运行CGI脚本时，为什么python不能找到一些模块？

Question

我不知道这里可能出现什么问题：

我有一些来自Biopython的模块，我可以在使用交互式提示或通过命令行执行python脚本时轻松导入。

问题是，当我尝试在web可执行的cgi脚本中导入相同的biopython模块时，我得到一个“导入错误”

：没有名为Bio的模块

这里有什么想法？

Answer 1

这里有几种可能性：

• Apache（在Unix上）通常作为不同的用户运行，并且在不同的环境中从命令行运行到python。尝试制作一个只打印出sys.version和sys.prefix的小脚本，并通过apache和命令行比较结果，以确保在两种环境中都运行相同的python安装。
• Biopython是安装在您的主目录下，还是只能为您的普通用户读取？同样，因为apache通常以不同的用户身份运行，所以您可能无法访问该位置，因此无法导入它。
• 在尝试导入Biopython之前，你能尝试做import site吗？当您通过apache运行时，可能会阻止导入站点包。

Answer 2

在cgi脚本中，您可以尝试在导入之前添加此包的路径。

sys.path.insert(0, 'path to biopython package')

如果您使用的是Apache，则应该能够使用指令SetEnv在conf文件中设置PYTHONPATH

SetEnv PYTHONPATH "path to biopython package"

Answer 3

我有同样的问题。我通过终端中的命令更改Linux Ubuntu中Apache的用户来解决这个问题：

sudo gedit /etc/apache2/envvars

请将www-data和export APACHE_RUN_USER上的export APACHE_RUN_GROUP更改为可以运行python脚本的当前用户或用户。玩的很开心 ;）