R - 更改 corrplot 的轴标签大小

Question

我将以下内容与

corrplo

t 一起使用：

require("corrplot") ## needs the corrplot package
corrplot(cor(lpp_axis1, lpp_axis2), method=c("number"), bg = "grey10",
         addgrid.col = "gray50", tl.offset = 2, tl.cex=2,
         tl.col = "black", 
         col = colorRampPalette(c("yellow","green","navyblue"))(100))

这是使用此处提供的 csv 文件创建的。

图表很好，我可以根据需要调整 cl 标签。我尝试调整 x 轴和 y 轴上的标签，但没有任何影响。我考虑过改变 mar - 但我还没有找到方法。我尝试使用 cex.label 更改大小失败。

问题 - 如何使 corrplot （不是 cl，不在网格中）显示的文本更大？

两个轴是以下数据框：

lpp_axis1 <- data.frame("Compile Source Code" = Q3A.1, "View Source Code" = Q3A.2, "Change Source Code" = Q3A.3, "Write Documentation" = Q3A.8, "File Bug Reports"= Q3B.3, "Ask Questions" = Q3B.5, "Provide Answers" = Q3B.6, "Overall Participation" = Q3a3bConsolidated)

lpp_axis2 <- data.frame("Identification" = Q1,"Overall Learning" = Q6Consolidated,  "Learning Programming" = Q6.1,  "Learning about Computers" = Q6.2, "Learning Teamwork" =  Q6.3)

输出

str(lpp_axis1)

是

> str(lpp_axis1)
'data.frame':   4603 obs. of  8 variables:
 $ Compile.Source.Code  : int  4 2 3 2 2 2 3 2 2 0 ...
 $ View.Source.Code     : int  4 2 1 1 2 2 3 1 1 0 ...
 $ Change.Source.Code   : int  4 1 0 1 2 1 2 1 1 0 ...
 $ Write.Documentation  : int  4 1 2 2 3 0 3 0 1 0 ...
 $ File.Bug.Reports     : int  4 4 1 2 2 0 2 0 0 0 ...
 $ Ask.Questions        : int  4 4 2 4 2 1 2 1 3 0 ...
 $ Provide.Answers      : int  2 4 1 4 4 0 3 1 3 0 ...
 $ Overall.Participation: int  49 26 14 32 31 8 27 10 15 0 ...

的输出

packageDescription("corrplot")

表示：

Package: corrplot
Type: Package
Title: visualization of a correlation matrix
Version: 0.30
Date: 2010-05-30
Author: Taiyun Wei
Suggests: seriation, cairoDevice, Cairo,
Maintainer: Taiyun Wei <[email protected]>
Description: The corrplot package is a graphical display of a
        correlation matrix, confidence interval. It also contains some
        algorithms to do matrix reordering.
License: GPL-2 | GPL-3
LazyLoad: yes
URL: http://corrplot.r-forge.r-project.org
Repository: CRAN
Repository/R-Forge/Project: corrplot
Repository/R-Forge/Revision: 45
Date/Publication: 2010-05-31 07:44:14
Packaged: 2010-05-30 20:39:16 UTC; rforge
Built: R 2.11.1; ; 2011-03-19 00:22:49 UTC; unix

-- File: /home/user/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/2.11/corrplot/Meta/package.rds 
> 

corrplot 维护者回复了可用的替代 corrplot.r here

使用此 corrplot 和下面的示例代码，文本大小是可以接受的。然而，尝试增加它也会产生相同的效果。

source("http://misterdavis.org/R_info/corrplot.r")
corrplot(cor(lpp_axis1, lpp_axis2), addn=T,
         addgrid.col = "gray50", tl.cex=2, assign.col="min2max",
         tl.col = "black", cl.ratio=0.4, addcolor="no",
         col = colorRampPalette(c("yellow","green","blue"))(100))

使用此处可用的早期版本的相关圈，可以根据自己的喜好调整文本。 （尽管该图缺少后来更精致的 corrplot 包的一些功能。） cex 可以用于 cex。如果时间允许，我可能会尝试调整两者，以找到一个折中方案。

使用旧的相关圆脚本，以下代码可生成足够大的 X 和 Y 轴标签：

circle.corr(cor(lpp_axis1, lpp_axis2), bg = "gray50",   col = colorRampPalette(c("navyblue","white", "red"))(100), cex=1.5)

Answer 1

更新2

实际上，由于提供了代码和数据，现在有了一个真正的可重现示例：

d1 <- read.csv(url("http://misterdavis.org/r_wiki/r_results_1231_2010"))
lpp_axis1 <- with(d1, data.frame("Compile Source Code" = Q3A.1,
                                 "View Source Code" = Q3A.2,
                                 "Change Source Code" = Q3A.3, 
                                 "Write Documentation" = Q3A.8, 
                                 "File Bug Reports"= Q3B.3,
                                 "Ask Questions" = Q3B.5,
                                 "Provide Answers" = Q3B.6,
                                 "Overall Participation" = Q3a3bConsolidated))

lpp_axis2 <- with(d1, data.frame("Identification" = Q1,
                                 "Overall Learning" = Q6Consolidated,  
                                 "Learning Programming" = Q6.1,
                                 "Learning about Computers" = Q6.2, 
                                 "Learning Teamwork" =  Q6.3))

corrplot(cor(lpp_axis1, lpp_axis2), method=c("number"), bg = "grey10",
         addgrid.col = "gray50", tl.cex=1,
         tl.col = "black", 
         col = colorRampPalette(c("yellow","green","navyblue"))(100))
dev.new()
corrplot(cor(lpp_axis1, lpp_axis2), method=c("number"), bg = "grey10",
         addgrid.col = "gray50", tl.cex=2,
         tl.col = "black", 
         col = colorRampPalette(c("yellow","green","navyblue"))(100))

dev.new()

允许您同时在屏幕上进行比较，而无需将绘图区域分成两个面板。

tl.offset

似乎造成的问题比其价值更多，所以我将其排除在外。我包括下面两个数字：

与

tl.cex = 1

与

tl.cex = 2

如您所见，我无法重现您所看到的问题；

tl.cex

只是改变轴标签的大小。请注意，这没有使用

tl.offset

，但其余的绘图代码与您的相同。

这就是我从

packageDescription()

得到的：

R> packageDescription("corrplot")
Package: corrplot
Type: Package
Title: visualization of a correlation matrix
Version: 0.30
Date: 2010-05-30
Author: Taiyun Wei
Suggests: seriation, cairoDevice, Cairo,
Maintainer: Taiyun Wei <[email protected]>
Description: The corrplot package is a graphical display of a
        correlation matrix, confidence interval. It also contains some
        algorithms to do matrix reordering.
License: GPL-2 | GPL-3
LazyLoad: yes
URL: http://corrplot.r-forge.r-project.org
Repository: CRAN
Repository/R-Forge/Project: corrplot
Repository/R-Forge/Revision: 45
Date/Publication: 2010-05-31 07:44:14
Packaged: 2010-05-30 20:39:16 UTC; rforge
Built: R 2.13.0; ; 2011-04-01 12:33:21 UTC; unix

-- 文件：/home/gavin/R/libs/corrplot/Meta/package.rds

将其与您系统上的进行比较，并尝试上面的示例，以便我们运行完全相同的代码进行比较。

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原始示例 这是一个可重现的示例：

require(corrplot)
data(mtcars)
corr <- cor(mtcars)
corrplot(corr, method = "number", tl.cex = 2)

更新

好的，我现在看到问题了。使用

tl.offset

，您可以将标签从相关图形进一步推到边缘。这似乎是

corrplot()

中的一个错误，就好像您没有设置

tl.offset

一样，它会缩放相关图形以适应标签。我能看到的唯一解决方案是根本不设置

tl.offset

，或者将其设置为较小的值这是一个极端的例子：

layout(matrix(1:2, ncol = 2))
corrplot(corr, method = "number", tl.cex = 2, tl.offset = 3)
corrplot(corr, method = "number", tl.cex = 2)
layout(1)

您可以通过更改绘图设备的相对尺寸来改进 - 如果在屏幕上，则增加绘图设备窗口的宽度或高度（或两者），直到所有标签都可见。如果这是另一个设备（比如

pdf()

或

png()

），那么您需要在创建设备时更改设备的尺寸。

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原始[可重现的示例]给出：

您不清楚 x 和 y 轴标签有什么问题，但

corrplot()

改变了绘图边距以适应标签。您已经通过设置参数

tl.cex = 2

指定了这些 x 和 y 轴标签的相对大小。如果您希望标签更大，请增加此值：

corrplot(corr, method = "number", tl.cex = 4)

如果您想要更小的标签，请将

tl.cex

设置为更小的值：

corrplot(corr, method = "number", tl.cex = 0.8)

鉴于这些是绘图上唯一的 x 和 y 标签，这有帮助吗？如果没有，哪些标签需要更改？

Answer 2

您可以尝试使用 par 更改文本的磅值。我认为默认大小是 12。
在

par( ps=14)

之前添加像

corrplot

这样的行应该会使文本变大。

Answer 3

鉴于您添加的示例，您可能需要增加绘图的尺寸并设置外边距以适应标签的长度。

可以使用

par()$pin

访问当前绘图尺寸，并使用

par()$omi

访问外边距。

您可以通过调整以下示例来更改绘图尺寸和外边距：

require("corrplot")         ## needs the corrplot package  
data(mtcars)  
  corr <- cor(mtcars)    
par(pin=c(7,7))              ##  (width, height) in inches    
par(omi=c(0,1,1,0.5))        ## (bottom, left, top, right)  in inches  
corrplot(corr, method="number", tl.cex = 2)

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Answer 4

corr() 函数中的 cl.cex 参数应该改变所需标签的大小。