projectRaster占用太多内存

Question

我正在R中进行一些空间处理，并且突然之间，我的一些代码将无法在我使用多年的计算机上运行，​​特别是因为它“内存不足”。

## Raster going in
xx <- raster(fatNames[[i]])
xx
class       : RasterLayer 
dimensions  : 5160, 14436, 74489760  (nrow, ncol, ncell)
resolution  : 0.008333333, 0.008333333  (x, y)
extent      : -172.3, -52, 23.5, 66.5  (xmin, xmax, ymin, ymax)
coord. ref. : +proj=longlat +datum=WGS84 +no_defs +ellps=WGS84 +towgs84=0,0,0 
data source : D:\Dropbox\wintor_aux\Results\myluFatReq_100_2_fat.inf.tif 
names       : myluFatReq_100_2_fat.inf 
values      : 0.1831425, 3.449095  (min, max)

## transform
x.rast <- projectRaster(xx,crs = CRS("+init=epsg:2955"))

错误：无法提供4.2Gb的向量。

现在，我知道这是一个大小合适的栅格（输入栅格大小：75.5 MB），但是该机器具有32Gb的RAM，没有其他程序在运行，并且我仍然占用内存。多年来，我已经做过数百次这样的事情，据我所知，自从大约一个月前我这样做以来，机器上的任何东西都没有改变。

我已经尝试重新启动会话，重新启动计算机，并在Google上进行了一些搜索，但是我仍然没有运气来查找问题。当我在具有1/2 RAM的机器上尝试相同的代码块时，我能够运行它没有问题（使用〜8Gb内存最大）。有人对我如何追逐这件事有任何建议吗？

> sessionInfo()
R version 3.5.1 (2018-07-02)
Platform: x86_64-w64-mingw32/x64 (64-bit)
Running under: Windows >= 8 x64 (build 9200)

Matrix products: default

locale:
[1] LC_COLLATE=English_New Zealand.1252  LC_CTYPE=English_New Zealand.1252   
[3] LC_MONETARY=English_New Zealand.1252 LC_NUMERIC=C                        
[5] LC_TIME=English_New Zealand.1252    

attached base packages:
[1] stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods   base     

other attached packages:
[1] raster_2.6-7         rgdal_1.3-3          sp_1.3-1             sf_0.6-3            
[5] RevoUtils_11.0.1     RevoUtilsMath_11.0.0

loaded via a namespace (and not attached):
 [1] Rcpp_0.12.18    lattice_0.20-35 class_7.3-14    grid_3.5.1      spData_0.2.9.0 
 [6] DBI_1.0.0       magrittr_1.5    e1071_1.7-0     units_0.6-0     tools_3.5.1    
[11] yaml_2.2.0      compiler_3.5.1  classInt_0.2-3 

Answer 1

您应该首先将光栅包更新为当前（CRAN）版本。这可能会解决此问题。如果没有，这可能是一个极端的情况，您应该可以通过将内存参数设置为较小的值来解决。在当前版本中，您可以执行rasterOptions(memfrac=.3)。在当前和较旧的版本中，您可以尝试rasterOptions(maxmemory=1e+08)

顺便说一下，鉴于输入数据的经度跨度为（172.3-52）= 120度，因此您转换为+proj=utm +zone=11（请不要在示例中使用espg代码）似乎相当可疑-UTM对大约6度的跨度。