Matplotlib“ ValueError：图像大小在每个方向上小于…的2 ^ 16”，具有对数刻度

Question

玩具问题：

import matplotlib.pyplot as plt

x = [10, 11, 12, 15]
y = [5, 7, 4, 3]
z = ["a", "b", "c", "d"]

fig, ax = plt.subplots(figsize = (6, 6))
ax.bar(x, y)

for i, j in enumerate(zip(y, z)):
    plt.text(i + 10, j[0] - 0.3, s = str(j[0]), color = 'white')
    plt.text(i + 10, j[0] + 0.1, s = str(j[1]), color = 'black')

plt.show()

这会创建一个绘图，其实际值作为文本标签，很不错。文本标签未在每个小节上方对齐，因为x值之间存在间隙。

不用担心，可以插入一些数据：

import matplotlib.pyplot as plt

x = [10, 11, 12, 15]
y = [5, 7, 4, 3]
z = ["a", "b", "c", "d"]

x.insert(3, 13)
x.insert(4, 14)
y.insert(3, 0)
y.insert(4, 0)
z.insert(3, ' ')
z.insert(4, ' ')

fig, ax = plt.subplots(figsize = (6, 6))
ax.bar(x, y)
# ax.set_yscale('log')

for i, j in enumerate(zip(y, z)):
    plt.text(i + 10, j[0] - 0.3, s = str(j[0]), color = 'white')
    plt.text(i + 10, j[0] + 0.1, s = str(j[1]), color = 'black')

plt.show()

甜，正是我们想要的，美丽的情节。

但是...

# ax.set_yscale('log')

如果未注释set_yscale（'log'）：

ValueError: Image size of 384x806494 pixels is too large. It must be less than 2^16 in each direction.

因此您在y值中不能有0，因为未定义log 0。很有道理。

除了现在，我无法解决原始问题，因为0不能用来表示一个空的条。

log 1 = 0，但是如果您插入1，则仍然显示条形，因为我想是原因？

对于matplotlib版本'2.2.3'，是否有任何解决方法？如果不能使用0，怎么办？

谢谢

Answer 1

一种解决方法是在绘制并以线性比例绘制之前记录您的y值：

import matplotlib.pyplot as plt
import numpy as np

x = [10, 11, 12, 15]
y = [5, 7, 4, 3]
z = ["a", "b", "c", "d"]

x.insert(3, 13)
x.insert(4, 14)
y.insert(3, 0)
y.insert(4, 0)
z.insert(3, ' ')
z.insert(4, ' ')

fig, ax = plt.subplots(figsize = (6, 6))

mask = ~np.isinf(np.log(y)) # get mask of non-inf values
ax.bar(np.array(x)[mask], np.log(y)[mask]) # plot only non-inf values

for i, j in enumerate(zip(y, z)):
    if not j[0]:
        continue

    plt.text(i + 10, np.log(j[0]) - 0.08, s = str(j[0]), color = 'white')
    plt.text(i + 10, np.log(j[0]) + 0.02, s = str(j[1]), color = 'black')

plt.show()

我必须更改文本的y值以使其看起来不错。看一下下面的结果：