如何在 COVID 输入 fasta 上运行最新的 Docker 版本的 Nextclade？

Question

我尝试运行以下 Shell 代码：

 sudo docker run -it --rm nextstrain/nextclade:latest nextclade run --dataset-name 'sars-cov-2' - 
 -output-all  covid19.fasta # fasta file has the data I want to process

无法处理任何内容，更改标志和选项，没有任何反应...... 你知道如何在 Linux Mint 上以正确的方式运行它吗，你能建议一个关于这个最新版本的教程吗，当前的文档描述了旧版本，Python 和 Deb 安装也不能正常工作。谢谢。

Answer 1

我自己应对：没有人回复我，都在冬眠或因为我是俄罗斯入侵者，我不知道为什么......谁在乎......

       sudo docker run -it --rm=True -v $PWD:/data   -u $(id -u):$(id -g) 
        nextstrain/nextclade:latest nextclade run  -d "sars-cov-2" 
       ./data/covid19.fasta  --output-all  ./data/NextcladeResults