ValueError:绘制散点图时,RGBA 值应在 0-1 范围内

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我正在尝试生成散点图来显示 PCA 变换之前和之后的数据,类似于此教程

为此,我运行以下代码:

fig, axes = plt.subplots(1,2)
axes[0].scatter(X.iloc[:,0], X.iloc[:,1], c=y)
axes[0].set_xlabel('x1')
axes[0].set_ylabel('x2')
axes[0].set_title('Before PCA')
axes[1].scatter(X_new[:,0], X_new[:,1], c=y)
axes[1].set_xlabel('PC1')
axes[1].set_ylabel('PC2')
axes[1].set_title('After PCA')
plt.show()

导致出现此错误的原因:

ValueError: RGBA values should be within 0-1 range

X是预处理后的特征矩阵,包含196个样本和59个特征。而 y 是因变量,包含两个类 [0, 1]。

这是完整的错误消息:

---------------------------------------------------------------------------
ValueError                                Traceback (most recent call last)
<ipython-input-109-2c4f74ddce3f> in <module>
      1 fig, axes = plt.subplots(1,2)
----> 2 axes[0].scatter(X.iloc[:,0], X.iloc[:,1], c=y)
      3 axes[0].set_xlabel('x1')
      4 axes[0].set_ylabel('x2')
      5 axes[0].set_title('Before PCA')

~/anaconda3/lib/python3.7/site-packages/matplotlib/__init__.py in inner(ax, data, *args, **kwargs)
   1597     def inner(ax, *args, data=None, **kwargs):
   1598         if data is None:
-> 1599             return func(ax, *map(sanitize_sequence, args), **kwargs)
   1600 
   1601         bound = new_sig.bind(ax, *args, **kwargs)

~/anaconda3/lib/python3.7/site-packages/matplotlib/axes/_axes.py in scatter(self, x, y, s, c, marker, cmap, norm, vmin, vmax, alpha, linewidths, verts, edgecolors, plotnonfinite, **kwargs)
   4495                 offsets=offsets,
   4496                 transOffset=kwargs.pop('transform', self.transData),
-> 4497                 alpha=alpha
   4498                 )
   4499         collection.set_transform(mtransforms.IdentityTransform())

~/anaconda3/lib/python3.7/site-packages/matplotlib/collections.py in __init__(self, paths, sizes, **kwargs)
    881         """
    882 
--> 883         Collection.__init__(self, **kwargs)
    884         self.set_paths(paths)
    885         self.set_sizes(sizes)

~/anaconda3/lib/python3.7/site-packages/matplotlib/collections.py in __init__(self, edgecolors, facecolors, linewidths, linestyles, capstyle, joinstyle, antialiaseds, offsets, transOffset, norm, cmap, pickradius, hatch, urls, offset_position, zorder, **kwargs)
    125 
    126         self._hatch_color = mcolors.to_rgba(mpl.rcParams['hatch.color'])
--> 127         self.set_facecolor(facecolors)
    128         self.set_edgecolor(edgecolors)
    129         self.set_linewidth(linewidths)

~/anaconda3/lib/python3.7/site-packages/matplotlib/collections.py in set_facecolor(self, c)
    676         """
    677         self._original_facecolor = c
--> 678         self._set_facecolor(c)
    679 
    680     def get_facecolor(self):

~/anaconda3/lib/python3.7/site-packages/matplotlib/collections.py in _set_facecolor(self, c)
    659         except AttributeError:
    660             pass
--> 661         self._facecolors = mcolors.to_rgba_array(c, self._alpha)
    662         self.stale = True
    663 

~/anaconda3/lib/python3.7/site-packages/matplotlib/colors.py in to_rgba_array(c, alpha)
    277             result[mask] = 0
    278         if np.any((result < 0) | (result > 1)):
--> 279             raise ValueError("RGBA values should be within 0-1 range")
    280         return result
    281     # Handle single values.

ValueError: RGBA values should be within 0-1 range

我不确定是什么原因导致了这个错误,希望能帮助您解决这个问题。谢谢!

python matplotlib scatter-plot valueerror
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c=
ax.scatter
参数可以通过多种方式给出:

  • 使用 cmap 和范数将 n 个数字映射到颜色的标量或序列。所以是一个数字,或者一个类似列表的一维数字序列。
  • 行为 RGB 或 RGBA 的 2D 数组。例如。像
    [[1,0,0], [0,0,1]]
    之类的东西。 所有这些值都必须介于 0 和 1 之间。此外,每个条目应该有 3 个(对于 RGB)或 4 个(对于 RGBA)值。
  • 长度为 n 的颜色序列。例如。
    ["red", "#B789C0", "turquoise"]
  • 单色格式字符串。例如。
    "cornflowerblue"

现在,当给出一个数字数组时,为了能够区分第一种情况和第二种情况,matplotlib 仅查看数组维度。如果是一维,matplotlib 假设第一种情况。对于 2D,它假设第二种情况。 请注意,

Nx1
1xN
数组也被视为二维。 您可以使用
np.squeeze()
来“挤出”虚拟第二维度。


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在每个 RGB 值周围使用此函数:

def rgb_normalized(rgb_no): 返回 (1/256)*rgb_no

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