将nan值转换为零

问题描述 投票:57回答:9

我有一个2D numpy数组。这个数组中的一些值是NaN。我想使用这个数组执行某些操作。例如,考虑数组:

[[   0.   43.   67.    0.   38.]
 [ 100.   86.   96.  100.   94.]
 [  76.   79.   83.   89.   56.]
 [  88.   NaN   67.   89.   81.]
 [  94.   79.   67.   89.   69.]
 [  88.   79.   58.   72.   63.]
 [  76.   79.   71.   67.   56.]
 [  71.   71.   NaN   56.  100.]]

我试图逐行取一行,按相反顺序对其进行排序,以从行中获取最多3个值并取其平均值。我试过的代码是:

# nparr is a 2D numpy array
for entry in nparr:
    sortedentry = sorted(entry, reverse=True)
    highest_3_values = sortedentry[:3]
    avg_highest_3 = float(sum(highest_3_values)) / 3

这不适用于包含NaN的行。我的问题是,是否有一种快速的方法可以将所有NaN值转换为2D numpy数组中的零,这样我就没有排序和其他我想做的事情的问题。

python numpy nan
9个回答
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这应该工作:

from numpy import *

a = array([[1, 2, 3], [0, 3, NaN]])
where_are_NaNs = isnan(a)
a[where_are_NaNs] = 0

在上述情况中,where_N_NaNs是:

In [12]: where_are_NaNs
Out[12]: 
array([[False, False, False],
       [False, False,  True]], dtype=bool)

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A是你的2D数组:

import numpy as np
A[np.isnan(A)] = 0

函数isnan生成一个bool数组,指示NaN值的位置。布尔数组可用于索引相同形状的数组。把它想象成一个面具。


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nan_to_num()怎么样?


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drake's answer使用nan_to_num的代码示例:

>>> import numpy as np
>>> A = np.array([[1, 2, 3], [0, 3, np.NaN]])
>>> A = np.nan_to_num(A)
>>> A
array([[ 1.,  2.,  3.],
       [ 0.,  3.,  0.]])

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nan绝不等于nan

if z!=z:z=0

所以对于2D阵列

for entry in nparr:
    if entry!=entry:entry=0

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您可以使用np.where找到NaN的位置:

import numpy as np

a = np.array([[   0,   43,   67,    0,   38],
              [ 100,   86,   96,  100,   94],
              [  76,   79,   83,   89,   56],
              [  88,   np.nan,   67,   89,   81],
              [  94,   79,   67,   89,   69],
              [  88,   79,   58,   72,   63],
              [  76,   79,   71,   67,   56],
              [  71,   71,   np.nan,   56,  100]])

b = np.where(np.isnan(a), 0, a)

In [20]: b
Out[20]: 
array([[   0.,   43.,   67.,    0.,   38.],
       [ 100.,   86.,   96.,  100.,   94.],
       [  76.,   79.,   83.,   89.,   56.],
       [  88.,    0.,   67.,   89.,   81.],
       [  94.,   79.,   67.,   89.,   69.],
       [  88.,   79.,   58.,   72.,   63.],
       [  76.,   79.,   71.,   67.,   56.],
       [  71.,   71.,    0.,   56.,  100.]])

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你可以使用numpy.nan_to_num

numpy.nan_to_num(x):用零和inf替换有限数字的nan。

示例(请参阅doc):

>>> np.set_printoptions(precision=8)
>>> x = np.array([np.inf, -np.inf, np.nan, -128, 128])
>>> np.nan_to_num(x)
array([  1.79769313e+308,  -1.79769313e+308,   0.00000000e+000,
        -1.28000000e+002,   1.28000000e+002])

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您可以使用lambda函数,一维数组的示例:

import numpy as np
a = [np.nan, 2, 3]
map(lambda v:0 if np.isnan(v) == True else v, a)

这会给你结果:

[0, 2, 3]

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出于您的目的,如果所有项目都存储为str,您只需使用已排序,然后检查第一个元素并将其替换为“0”

>>> l1 = ['88','NaN','67','89','81']
>>> n = sorted(l1,reverse=True)
['NaN', '89', '88', '81', '67']
>>> import math
>>> if math.isnan(float(n[0])):
...     n[0] = '0'
... 
>>> n
['0', '89', '88', '81', '67']
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