我试图绘制相当大量的数据,一直追溯到1998年。
我的代码似乎工作正常,但运行时抛出错误消息“BokehUserWarning:ColumnDataSource的列必须具有相同的长度”
这是我的代码:
import pandas as pd
from bokeh.io import show, output_file, gridplot
from bokeh.plotting import figure
#Create dataframe
df = pd.read_csv('/Users/macbook/Desktop/source.tab', names=[
'#','datesent','total','place'] delimiter='\t', header=None, encoding="ISO-8859-1")
#Format date
df['datesent'] = pd.to_datetime(df['datesent'], dayfirst=True)
#Datamunging
transactionssent = dict(pd.melt(df,value_vars=['datesent']).groupby('value').size())
transactionssent_dataframe = pd.DataFrame.from_dict(transactionssent, orient= 'index')
transactionssent_dataframe.columns = ['Number of sent transactions']
transactionssent_dataframe.index.rename('Date of sending', inplace= True)
#X- and Y-axis
x = pd.bdate_range('2017-1-1', '2200-1-1')
y = transactionssent_dataframe['Number of sent transactions']
#Bokeh object
ts = figure(x_axis_type="datetime")
#Show plot
ts.line(x, y)
output_file('/Users/macbook/Desktop/plot.html')
所有输出实际上都是预期的。错误是什么意思?我真的必须从数据框创建一个ColumndDataSource对象吗?我认为将pandas数据帧直接传递给散景图功能是获取我想要的图形的好方法。是否有从熊猫日期框架创建散景图的最佳实践?
我假设验证错误来自你的x
和y
系列的长度不同。如果有意义的话,输出可能会切断较长阵列的悬垂部分。
你没有“必须”手动创建一个ColumnDataSource(一个是在将数组传递给像line
这样的字形方法时在内部创建的),但它有一些有助于防止这种情况的验证。
您可以通过以下方式直接从数据框创建ColumnDataSource:
source = ColumnDataSource(dataframe)
ts.line(x='x', y='y', source=source)
此答案与问题没有直接关系,但引用了相同的警告:如果在交互式图中更改ColumnDataSource的长度,如果逐步更改,则会得到相同的警告,例如:您的数据来源是:
source = ColumnDataSource(
data=dict(
x=list(np.zeros(10)),
y=list(np.ones(10)),
)
)
p1 = plot.line(x='x', y='y', source=source, line_alpha=1, color="red")
并且您要更新的数据的长度为例如你可以这样做:
p1.data_source.data['x'] = list(np.zeros(8))
p1.data_source.data['y'] = list(np.ones(8))
这将产生与上述相同的警告。要避免警告,请使用dict设置值:
p1.data_source.data = {'x': list(np.zeros(8)),
'y': list(np.ones(8))}