我正在尝试创建一条具有密度曲线的条形图,以显示条形趋势,请参见图1中的示例(我通过PowerPoint创建了此示例)。填充对应于时间列,y对应于丰度值,x对应于物种。
但是,在我编写的脚本中,我无法绘制该图。这里有人知道如何改进我的脚本吗?
data<-read.csv(file= "data.csv", header= TRUE, sep= ";" )
names(data)
library(ggplot2)
library(plyr)
library(dplyr)
mu <- ddply(data, "Time", summarise, grp.mean=mean(body_mass))
head(mu)
ggplot(data, aes(x=body_mass, y=Abund, color=Time, fill=Time)) +
geom_histogram(aes(y=..density..), position="identity", alpha=0.5)+
geom_density(alpha=0.6)+
geom_vline(data=mu, aes(xintercept=grp.mean, color=warfare),
linetype="dashed")+
scale_color_manual(values=c("#E69F00", "#56B4E9", "#FF1234"))+
scale_fill_manual(values=c("#E69F00", "#56B4E9", "#FF1234"))+
labs(title="Abundance",x="body mass", y = "abundancey")+
theme_classic()
specie body_mass Time Abund
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