它是代表蛋白质表面的较大,水密,三角形网格的一部分。
我想做的是发现在其他蛋白质中是否发现了这种特殊的“子网格”。但是,我不是在寻找完美的拟合,相当相似的“子网格”,因为我唯一会发现这种确切形状在原始蛋白质中。 我一直在阅读Python模块Trimeh和Open3D的文档。 Trimesh确实有一个比较模块,但是它似乎没有我想要的功能。此外,Open3D具有“计算点云距离”功能,该功能建议比较两个点云或网格之间的差异。 novey,由于我实际上要找到的是相似性,我将需要一种将我的腔的“子网”适合要分析的蛋白质表面的方法,然后“得分”如何不同或变形。安装的订单是。另一种方法是旋转和翻译我的子网格,以匹配我猜的蛋白质表面上的最大顶点和面孔。 我是个头脑,我是一名生物技术学家,在Python中自学,并且在任何3D方面的经验极为有限。在这一点上,任何有帮助的东西,无论是纸张,python模块还是您认为可能有用的任何知识。
感谢您为此提供的任何帮助!如果答案不晚,我建议您看到纸张形状分布。本文转移形状之间的比较与比较更好的分布曲线。一点点数学就足够了。 顺便说一句,蛋白质腔演示很漂亮。我认为它是由三角形网格组成的,网格中的每个点/顶点是否代表蛋白质中的原子?如果是这样,您是如何从原子中获得网眼的。我对这个问题非常感兴趣。期待您的答复!