R中适合各种值的线性模型

Question

在该实验中，对动物尝试了四种不同的饮食。然后研究人员测量了它们对凝血时间的影响。

 ## Data :
    coag diet
 1    62    A
 2    60    A
 3    63    A
 4    59    A
 5    63    B
 6    67    B
 7    71    B
 8    64    B
 9    65    B
 10   66    B
 11   68    C
 12   66    C
 13   71    C
 14   67    C
 15   68    C
 16   68    C
 17   56    D
 18   62    D
 19   60    D
 20   61    D
 21   63    D
 22   64    D
 23   63    D
 24   59    D

我正在尝试通过在R中使用函数lm来拟合coag〜diet的线性模型结果应如下所示：

> modelSummary$coefficients
                 Estimate Std. Error       t value     Pr(>|t|)
(Intercept)  6.100000e+01   1.183216  5.155441e+01 9.547815e-23
dietB        5.000000e+00   1.527525  3.273268e+00 3.802505e-03
dietC        7.000000e+00   1.527525  4.582576e+00 1.805132e-04
dietD       -1.071287e-14   1.449138 -7.392579e-15 1.000000e+00

到目前为止，我的代码看起来不像结果：

coagulation$x1 <- 1*(coagulation$diet=="B")
coagulation$x2 <- 1*(coagulation$diet=="C")
coagulation$x3 <- 1*(coagulation$diet=="D")
modelSummary <- lm(coag~1+x1+x2+x3, data=coagulation)

Answer 1

"diet"是一个字符变量，被视为一个因素。因此，您可以省略虚拟编码，然后执行：

summary(lm(coag ~ diet, data=coagulation))$coefficients
#                 Estimate Std. Error      t value     Pr(>|t|)
# (Intercept) 6.100000e+01   1.183216 5.155441e+01 9.547815e-23
# dietB       5.000000e+00   1.527525 3.273268e+00 3.802505e-03
# dietC       7.000000e+00   1.527525 4.582576e+00 1.805132e-04
# dietD       2.991428e-15   1.449138 2.064281e-15 1.000000e+00

即使"diet"是数字变量，并且您希望R将其视为分类变量而不是连续变量，也不需要伪编码，您只需将其作为+ factor(diet)添加到公式中即可。

如您所见，由于1 +默认会计算lm，因此(Intercept)也是多余的。要省略拦截，您可以执行0 +（或- 1）。

Answer 2

该演示文稿是summary(modelSummary)（summary.lm类的属性，而不是modelSummary（lm类的属性。）。

summary(modelSummary)$coefficients
#                 Estimate Std. Error      t value     Pr(>|t|)
# (Intercept) 6.100000e+01   1.183216 5.155441e+01 9.547815e-23
# x1          5.000000e+00   1.527525 3.273268e+00 3.802505e-03
# x2          7.000000e+00   1.527525 4.582576e+00 1.805132e-04
# x3          2.991428e-15   1.449138 2.064281e-15 1.000000e+00

Answer 3

您也可以考虑以这种方式编码diet

coagulation$diet <- factor(coagulation$diet)

modelSummary<-lm(coag~diet,coagulation)

summary(modelSummary)

Call:
lm(formula = coag ~ diet, data = coagulation)

Residuals:
   Min     1Q Median     3Q    Max 
 -5.00  -1.25   0.00   1.25   5.00 

Coefficients:
             Estimate Std. Error t value Pr(>|t|)    
(Intercept) 6.100e+01  1.183e+00  51.554  < 2e-16 ***
dietB       5.000e+00  1.528e+00   3.273 0.003803 ** 
dietC       7.000e+00  1.528e+00   4.583 0.000181 ***
dietD       2.991e-15  1.449e+00   0.000 1.000000    
---
Signif. codes:  0 ‘***’ 0.001 ‘**’ 0.01 ‘*’ 0.05 ‘.’ 0.1 ‘ ’ 1