roc_auc_score - y_true中只有一个类

Question

我在现有的数据帧上做了k-fold XV，我需要获得AUC分数。问题是 - 有时测试数据只包含0，而不是1！

我尝试使用this示例，但使用不同的数字：

import numpy as np
from sklearn.metrics import roc_auc_score
y_true = np.array([0, 0, 0, 0])
y_scores = np.array([1, 0, 0, 0])
roc_auc_score(y_true, y_scores)

我得到这个例外：

ValueError：y_true中只有一个类。在这种情况下，没有定义ROC AUC分数。

是否有任何解决方法可以使其在这种情况下工作？

Answer 1

您可以使用try-except来防止错误：

import numpy as np
from sklearn.metrics import roc_auc_score
y_true = np.array([0, 0, 0, 0])
y_scores = np.array([1, 0, 0, 0])
try:
    roc_auc_score(y_true, y_scores)
except ValueError:
    pass

现在，如果只有一个类，你也可以将roc_auc_score设置为零。但是，我不会这样做。我猜您的测试数据非常不平衡。我建议使用分层K折叠，这样你至少可以同时使用两个类。

Answer 2

我现在面临同样的问题，使用try-catch并没有解决我的问题。我开发了下面的代码来处理它。

import pandas as pd
import numpy as np

class KFold(object):

    def __init__(self, folds, random_state=None):

        self.folds = folds

        self.random_state = random_state

    def split(self, x, y):

        assert len(x) == len(y), 'x and y should have the same length'

        x_, y_ = pd.DataFrame(x), pd.DataFrame(y)

        y_ = y_.sample(frac=1, random_state=self.random_state)

        x_ = x_.loc[y_.index]

        event_index, non_event_index = list(y_[y == 1].index), list(y_[y == 0].index)

        assert len(event_index) >= self.folds, 'number of folds should be less than the number of rows in x'

        assert len(non_event_index) >= self.folds, 'number of folds should be less than number of rows in y'

        indexes = []

        #
        #
        #
        step = int(np.ceil(len(non_event_index) / self.folds))

        start, end = 0, step

        while start < len(non_event_index):

            train_fold = set(non_event_index[start:end])

            valid_fold = set([k for k in non_event_index if k not in train_fold])

            indexes.append([train_fold, valid_fold])

            start, end = end, min(step + end, len(non_event_index))


        #
        #
        #
        step = int(np.ceil(len(event_index) / self.folds))

        start, end, i = 0, step, 0

        while start < len(event_index):

            train_fold = set(event_index[start:end])

            valid_fold = set([k for k in event_index if k not in train_fold])

            indexes[i][0] = list(indexes[i][0].union(train_fold))

            indexes[i][1] = list(indexes[i][1].union(valid_fold))

            indexes[i] = tuple(indexes[i])

            start, end, i = end, min(step + end, len(event_index)), i + 1

        return indexes 

我刚刚写了那段代码而我没有详尽地测试它。它仅针对二进制类别进行了测试。希望它有用。

Answer 3

是的，这显然是一个错误！你的代码是完全正确的：

import numpy as np
from sklearn.metrics import roc_auc_score
y_true = np.array([0, 0, 0, 0])
y_scores = np.array([1, 0, 0, 0])
roc_auc_score(y_true, y_scores)

这是我的“修复”

from sklearn.metrics import roc_auc_score, accuracy_score
def roc_auc_score_FIXED(y_true, y_pred):
    if len(np.unique(y_true)) == 1: # bug in roc_auc_score
        return accuracy_score(y_true, np.rint(y_pred))
    return roc_auc_score(y_true, y_pred)