连接 netcdf 和 hdf5 文件

Question

我有两个数据文件，两种格式，一个是netcdf，另一个是hdf5。我希望将它们组合起来并将组合数据导出为 hdf5。我当前的解决方案包括将每个字典转换为 python 字典，然后组合字典并将组合字典转换为 hdf5。有没有更好的解决方案？

Answer 1

如果您已经在使用 python，最简单的方法是使用 xarray。 Xarray 可以将 NetCDF 和 HDF5 读入 xarray 数据集，然后您可以组合成一个数据集，然后写入 netcdf4（底层是 HDF5），例如：

import xarray as xr
import h5netcdf

ds1 = xr.open_dataset("/path/to/my/file.h5")
ds2 = xr.open_dataset("/path/to/my/file.nc")

ds = xr.concat([ds1, ds2])

ds.to_netcdf(ds)

当然，您可能需要对数据集 ds1 和 ds2 进行一些操作，以确保变量和维度匹配，以便将它们连接起来。