分层数据格式(HDF5)是一种二进制文件格式,用于存储大量数字数据。
使用 pytables 或 pandas 删除表或节点后释放 hdf5 磁盘内存
我正在将 HDFStore 与 pandas / pytables 一起使用。 删除表或对象后,hdf5 文件大小不受影响。当添加额外的对象来存储时,似乎这个空间会被重用,...
我正在尝试覆盖 hdf5 文件中的 pandas 数据帧。每次执行此操作时,文件大小都会增大,而存储的帧内容相同。如果我使用 mode='w' 我会丢失所有其他记录。 这是……
我正在用 C 编写一个模拟,并希望使用 HDF5 库在运行时将数据输出到 .h5 文件。以下代码用于输出文件: 无效输出数据(int t,int n_output)...
我正在尝试使用 Julia(版本 1.5.3)覆盖 HDF5 文件中的现有数据集,特别是 HDF5 包。我四处寻找答案,但令人惊讶的是我找不到
以下代码给我错误。 将 pandas 导入为 pd df = pd.DataFrame({'a': [1,2,3]}) df.to_hdf('temp.h5', key='df', mode='w') 这给了我错误。 缺少可选依赖项“表”...
内存错误:无法为形状为 (725000, 277, 76) 和数据类型 float64 的数组分配 30.4 GiB
它给出了内存错误,但内存容量从未达到。我的 SSH 上有 60 GB 的内存,完整的数据集进程消耗 30 我正在尝试用 k-fold 训练自动编码器。没有 k-...
我是使用 HDF5 文件的新手,我正在尝试读取形状为 (20670, 224, 224, 3) 的文件。每当我尝试将 hdf5 的结果存储到列表或其他数据结构中时,它都需要......
我想将硬盘上的大fortran记录(12G)映射到numpy数组。 (映射而不是加载以节省内存。) Fortran 记录中存储的数据不是连续的,因为它被记录分割
我有两个数据文件,两种格式,一个是netcdf,另一个是hdf5。我希望将它们组合起来并将组合数据导出为 hdf5。我当前的解决方案包括将每个都转换为 python 字典...
根据这个答案,适当的块大小对于优化 I/O 性能非常重要。 我是3000张jpg图片,大小从180kB到220kB不等。我将把它们保存为字节。 我知道 2 种方法...
我应该在 HDF Store 中创建一个带有索引的大框架还是许多组?
我每天有大约 150 万行的时间序列、一个 4 维索引和 2 列。到目前为止,我已将所有这些内容放入一个 DataFrame 中,并推入 HDFStore 中的单个组中。
使用Javascript从浏览器读取HDF5 version_hint.toFixed不是一个函数
所以我有一些来自Matlab的HDF5文件,格式为.mat(更改为.hdf5,没有任何区别) 在Python中使用h5py我可以毫无问题地提取我想要的数据,我运行一个Flask应用程序...
我正在尝试创建一个 hdf5 文件来存储一些生成的数据。保存部分很好(我认为),但在检索时,一些数据输入似乎丢失了。我将提供...
CMake 成功找到 HDF5 的 HL 组件,但未列出它的库
在构建目录中运行 make 时出现以下错误 /usr/bin/ld:找不到-lhdf5_hl collect2:错误:ld 返回 1 退出状态 错误:命令“x86_64-linux-gnu-g++”失败...
如何使用没有数据类型名称的数字条目创建 numpy 记录数组
我正在尝试创建一个 numpy 记录数组来匹配我从 HDF5 文件读取的数据。 HDF5数据集(dataset)的dtype为np.dtype(('u1', (3,)))。数据集[0]的数据类型...
我有一个由matlab创建的结构体数组,并存储在v7.3格式的mat文件中: struArray = struct('名称', {'一', '二', '三'}, 'id', {1,2,3}, '数据', {[1:1...
我有一个更大的数据转换实用程序,这是其中的一小部分。它将旧格式转换为内存,然后将内存写入基于 HDF5 的输出格式。下面是一个函数,WriteFloatDataset...
我正在尝试使用 hdf5 文件进行 ml,每当我创建或打开 hdf5 文件时,我都会收到此错误,顺便说一句,我在 Windows 上的 vscode 中使用 miniconda 环境。 导入h5py hdf5_filepa...
我正在用 C++ 编写一个 .h5 文件并使用一些 API 调用,如下所示。 HDF5 文档指出,应释放从这些函数返回的标识符以防止泄漏。 在我的代码中,...
我只是想从 hdf 数据库打开一个组。我将组名称保存在字符串变量中。但是 C++ 编译器给出以下错误。我想坚持用绳子,因为我正在做...