hdf5 相关问题

分层数据格式(HDF5)是一种二进制文件格式,用于存储大量数字数据。

在node-gdal-async中从二维数组写入新数据集

我正在尝试从 JavaScript 中的二维数组创建一个新数据集。但是,我似乎无法在文档中找到执行此操作的方法。 要创建新的数据集,我似乎必须在写入中使用 gdal.open...

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Python - HDF5 到 numpy 数组 - 内存不足

我有一个 HDF5 文件,包含 20'000'000 行,每行有 8 个 float32 列。总原始内存大小应约为 640MB。 我想在我的 Python 应用程序中加载这些数据,但是,在...

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有没有办法用Python读取hdf5文件?

我是编码新手,我想知道是否可以使用 python 读取 hdf5 文件。更具体地说,我希望访问列(按名称)以提取信息。 我已经使用标准p读取了h5文件...

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在 M1 Mac 上找不到 PyTables 的 HDF5 安装

在 M1 Mac、macOS Monterey 12.4、Python 3.10.3 上运行 pip 安装表 收集表 使用缓存表-3.7.0.tar.gz (8.2 MB) 安装构建依赖项...完成 获取需求...

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如何迭代所有 HDF5 文件并将它们保存为 csv 文件

我正在编写一个Python代码,它将循环遍历我的SMAP HDF5(10,000)文件。我想提取土壤水分根区和植被绿度。我的代码看起来像这样 `导入操作系统 导入表 重要...

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将多页 tiff 文件转换为 hdf5

我想询问有关将多页 tiff 转换为 h5 文件的问题。 我可以从图像中获取 2-d 数据数组,但我有 21GB 多页 tiff 容器,所以我需要将图像转换为 3-d 数据sh...

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从 C 中的 HDF5 数据框中读取单个列

我有一个 HDF5 数据库,每次只需要迭代加载一行。我无法理解如何使用 H5Sselect_hyperslab。 有一个与 h5py 库相关的类似主题......

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释放由 hdf5 库分配的内存

我正在运行一个动态分配内存并从 h5 文件加载字符串数组的 c 库。 使用后释放内存时出现错误,我不确定是windows问题还是我没有...

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Pytorch 数据集类在测试时返回两次 hdf5 数据

我一直在尝试使用未标记的数据测试我的级联模型。该过程涉及遍历特定目录中的每个数据实例,模型应为它们分配标签,...

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如何将 defaultdict 的字节数组转换为字典

我用这段代码从 h5 文件中读取: f = h5py.File(fname, "r") data = f.get('table1')[...] 数据是这样的: array(b"defaultdict(, {'B': [{'score': 4, 'ski...

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图像文件夹到 hdf5 文件

我正在尝试获取图像文件夹并将它们转换为 hdf5 文件类型以用于分类学习模型。文件夹中的每个图像都应与文件夹名称配对,如 ...

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如何在 C++ 中读取 HDF5 对象引用

我想使用 C++ 读取一个包含对象引用数组的 HDF5 文件。我可以在 python 中得到正确的结果,但我在 C++ 中遇到了麻烦。 我试了几个导师的C例子...

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无法从 python 中的 hdf 文件获取数据

我有两个 hdf 文件,hdf4 和 hdf5。在这两种情况下,我都可以使用各自的库(pyhdf 和 h5py)在 python 中加载文件。但在文件内部我只能读取数据字段名称、大小...

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数组存储数据,用Numpy/Pickle,还是HDF5,写一个string/json到数据库/文件,哪个工具比较好?

我在一家学生创业公司工作,我需要信息。也许这里有人开发过商业IT项目!! 您是否遇到过将数据存储在数组 (NumPy) 中的任务? ...

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执行python代码时内存消耗大

我有以下代码: 用 open('vector.h5', 'wb') 作为 f: f.close() vector = pd.HDFStore('vector.h5', 模式='r+') 用 open('compare.h5', 'wb') 作为 f: f.close() compare = pd.HDFStore('

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如何从 .h5 文件中提取数据并将其正确保存在 .txt 或 .csv 中?

经过大量搜索后,我找不到一种简单的方法来从 .h5 中提取数据并将其传递给 Numpy 或 Pandas 的 data.Frame 以保存在 .txt 或 .csv 文件中。 导入 h5py 将 numpy 导入为 np 小鬼...

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并行 HDF5 MPI I/O 传输模式的区别(独立与集体)

根据HDF5手册,可以通过HDF5函数H5Pset_dxpl_mpio(...)设置“MPI I/O传输模式”。其中一个参数是传输模式。它可以是

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在 TensorFlow 1.x 中使用 Keras 加载保存的模型时出错:“NotImplementedError:numpy() 仅在启用急切执行时可用”

我想运行这个 repo (https://github.com/hfawaz/ijcnn19attacks/blob/master/src/cleverhans_tutorials/tsc_tutorial_keras_tf.py) 在第 186 行,它尝试加载保存的 ML 模型 模型 = keras ....

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如何在带有 M1 的 MacOS 上安装 h5py(Keras 需要)?

我有一台 M1 MacBook。我已经使用 pyenv 安装了 python 3.9.1,并且有 pip3 版本 21.0.1。 我已经通过 brew install hdf5 安装了 homebrew 和 hdf5 1.12.0_1。 当我打字时 pip3 安装 h5py 我...

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访问 Xarray 数据集时的 HDF5 警告

我想了解是什么导致了我在以下情况下收到的警告消息: 在之前的操作中,我创建了一些 NetCDF 文件并使用 xarray 将它们保存到磁盘。

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