我有一个矩阵,要在其中创建热图。行名称是化验,而别名是CASRN,格式为“ 131-55-5”]
我的矩阵看起来像这样the data matrix for the heatmap
出于某种原因,密谋认为这些是日期,并将其转换为2000年3月之类的数据,给了我一个空白的情节。
在将数据框转换为我检查的矩阵之前,所有列都是因子。有什么方法可以确保我在绘制矩阵时数字不会变成日期?
这是我用于热图的代码
plot_ly(x=colnames(dm_new2), y=rownames(dm_new2), z = dm_new2, type = "heatmap") %>%
layout(margin = list(l=120))
使用一些随机数据来模拟您的数据集。只需将矩阵放入数据框即可。试试这个:
set.seed(42)
library(plotly)
library(dplyr)
library(tidyr)
dm_new2 <- matrix(runif(12), nrow = 4, dimnames = list(LETTERS[1:4], c("131-55-5", "113-48-4", "1582-09-8")))
# Put matrix in a dataframe
dm_new2 <- as.data.frame(dm_new2) %>%
# rownames to column
mutate(x = row.names(.)) %>%
# convert to long format
pivot_longer(-x, names_to = "y", values_to = "value")
dm_new2 %>%
plot_ly(x = ~x, y = ~y, z = ~value, type = "heatmap") %>%
layout(margin = list(l=120))
由reprex package(v0.3.0)在2020-04-08创建