igraph是一个免费的软件包,用于创建和操作大型无向和有向图。它是用C语言编写的,但是具有与R,Python或Ruby等高级语言的接口。
我有一个包含50个网络信息的大igraph作为这个例子:源目标STAR-delta c-Lgt-1 SUN-2受体......
我正在尝试创建一个自动报告,我使用edgebundleR创建一系列和弦图。我有一个功能,可以做一堆东西,或多或少有这种形式:plot_chords
我有一个图g,我想在这个图中使用igraph找到聚类,这是我的代码:g = Graph.Read_Ncol('karate.txt',directed = False)p = g.community_label_propagation()我试图打印。 ..
我有一个带有一组顶点的图形g和一个带有一些“特殊”顶点名称的列表。我希望图形显示一个标签,顶点名称仅适用于这些特殊顶点。我试过了 ...
我有一个大的,266个顶点有向图。我想打破一些路径,这样我就可以使用构成其属性的数据在两个路径之间运行t检验或ANOVA。麻烦的是我......
我试图通过预定义的节点标签将大型网络粗粒化到较小的网络。说:large_network = np.random.rand(100,100)labels = [1,1,1,1,5,5,5,5,5,5,5,5,0,0,0,...
我是R的新手。我想知道,给定一个图形的节点ID列表是否有任何快速的方法来连接该顶点之间的所有边缘并在该图形中创建一个集团? p.s:我在寻找......
我有一个未加权的图形,我想得到一个子图,它只包含节点和边,包含n个已知节点之间的最短路径。在这种情况下,3个节点(11,29和13是名称)。 ...
嗨,所以基本上让我们说我有一个网络(A),我想找到它的中心性。我使用:centrality(graph,directed = FALSE,normalized = TRUE)这返回每个节点的...
所以我使用all_shortest_paths得到一个输出,如下所示:PathsE $ res [[1]] + 4/990顶点,命名为:[1] Sortilin GGA1 Ubiquitin PIMT $ res [[2]] + 4/990顶点,命名:[1] ......
使用RColorBrewer基于顶点属性设置igraph顶点颜色
我在iGraph中有一个网络,它有多个代表各种因素的顶点属性。我想根据特定属性绘制图形时为顶点着色。类似于你如何使用......
我是R的新手。我有一个igraph图形对象,我随机标记了顶点TRUE或FALSE。有没有办法删除两个TRUE标记的顶点或两个FALSE标记的边之间的边...
在python-igraph中,在我看来,当你从图形中删除顶点时,顶点会被重命名为使用从0到n的连续顶点。要了解我的意思,请考虑以下程序:...
d = data.frame(offspring = c(“G2I1”,“G2I2”,“G2I3”,“G3I1”,“G3I2”,“G3I3”,“G3I4”,“G4I1”,“G4I2”,“G4I3”, “G4I4”,“G5I1”,“G5I2”,“G5I3”),parent1 = c(“G1I1”,“G1I2”,“G1I1”,“G2I1”,“......
我试图在图表中找到所有最大派系,而不重叠。函数max_cliques()返回图中所有可能的最大派系,但我希望每个顶点只包含在...中