ImageJ是一个基于Java的开源图像处理程序,广泛用于科学图像分析,特别是生命科学。请考虑在Image.sc论坛上询问ImageJ特定的问题:https://forum.image.sc/tags/imagej。此标记应用于有关ImageJ中/的编程问题。
我需要测量一大组叶子的叶面积。问题是每张图像都有不同的比例,因为它们是用不同高度的相机拍摄的。在每张纸旁边我放了一张图表......
我正在尝试使用斐济粒子分析来测量面积%,但我不知道如何构建宏
Stackoverflow 用户您好, 我目前正在写学士论文,有超过 1000 张图像需要分析。因此,我想制作一个宏,可以将这些图像裁剪为相同的...
我想使用 Fiji (ImageJ) 进行一些简单的预处理操作并创建一个二进制掩码。我只是使用 GUI,对自动程序不感兴趣。 我收到了以下...
我尝试在 Image J 上构建一个非常简单的宏,但无法自动关闭不需要的图像并处理想要的图像。 如果您打开多通道图像并运行分割通道,我...
需要 ImageJ 宏的帮助来处理子目录中的 TIFF 图像
我正在开发一个 ImageJ 宏,目标如下: 1.-打开输入目录。 2.-创建输出目录。 3.-跨多个级别的 subf 搜索名为“BRIGHT”的目录...
shinyapps.io 上部署的应用程序是否可以在客户端打开并运行另一个应用程序(斐济)?
我构建了一个在本地运行良好的 Shiny 应用程序,能够自动打开一个单独的应用程序(ImageJ Fiji),运行宏代码来分析图像,然后将结果反馈给 Shiny 应用程序
任何人都可以告诉我为什么使用这个宏我只是将第一个图像切片的 .png 文件而不是堆叠图像的 .png 文件作为每个图像的每个通道的输出?看起来像是 Z 项目的一部分...
我一直在使用 ImageJ,并注意到一个有用的功能,将 RAW 文件拖放到对话框中可以让 ImageJ 从文件名推断文件格式和尺寸。 例如,当你...
我正在尝试找到一种将两个堆栈合并在一起的方法。例如,我正在拍摄一些关于神经元体的 60 倍图像,然后我将以 60 倍的速度拍摄另一组基底树突图像。那怎么...
我想使用imageJ读取一些视频文件,但是我在界面中看不到菜单,这意味着没有“文件”,“编辑”......选项。 谁能告诉我为什么吗?多谢! 操作系统:Mac...
如何使用脚本从 ImageJ/Fiji 中的图形中自动提取数据点?
我正在致力于从 ImageJ/Fiji 中的图表中自动提取数据点。我需要一个脚本来指导用户选择图表上的感兴趣区域 (ROI)、校准...
ImageJ Macro 中 while 循环的行为出现意外不一致
我正在编写一个 ImageJ 宏来帮助进行复杂的组织分析。该宏中的一个函数输入具有 3 个现有不重叠 ROI 的图像,等待用户手动选择新的 ROI ...
斐济错误:文件 --> 导入 --> 图像序列 --> 虚拟堆栈:图像宽度和高度为 <= 0
我正在尝试导入 70 个多通道图像(.tif 格式)的图像序列,以便使用网格收集/拼接功能生成一张大图像。但是,当我导入...
有没有办法使用宏将 ImageJ 中多个图像的信息附加到结果表中?
我正在尝试编写一个宏来协助处理ImageJ中的多个动物图像。简而言之,我有多个包含动物照片的文件夹,需要在某些
我正在做免疫组织化学,我有两个不同的信号,想要进行细胞计数。 我的想法是在二维(标记 1、标记 2)中使用 z 堆栈(20 帧)。这对...来说没问题
如何理解我的 RICM 细胞粘附显微镜图像的 FFT(傅立叶变换)?
我正在尝试对图像进行分割,在处理图像时,我遇到在图像 J 中进行 FFT 并删除中心频率可以给你细胞的边缘。 但我无法理解...
ImageJ 宏遍历文件夹,一次合并三个图像,在第一次迭代期间跳过一个图像
我正在制作一个脚本,将通道合并到 4D 堆栈中。它应该一次在一个文件夹中获取三个图像,合并它们,然后保存合成图像。 我不明白的是,在...
我正在尝试通过斜边法计算 MTF 来评估光学系统。为此,我使用以下 ImageJ 插件: https://imagej.nih.gov/ij/plugins/se-mtf/index.html 不,我...
ImageJ:如何根据预定义的 RGB 值调整绘制的椭圆的颜色?
我使用 txt 文件绘制椭圆,该文件包含每个椭圆的所有参数(x、y 坐标、长/短轴、长轴角度)和 RGB 值。绘制椭圆是最简单的部分,但是...
我的代码获取图像并计算其平均亮度和标准差。当我在某个数据集 .TIF(通常很暗)上运行代码并比较我从 runn 获得的值时...