qsub 相关问题

Qsub是高性能计算作业的作业提交命令。

PBS Pro 自定义 stdout stderr 文件名

我想知道如何将 jobID 附加到自定义标准输出文件名。我不喜欢 PBS Pro 中的默认选项 jobname.o 和 jobname.e。使用 SLURM，我可以定义标准输出文件名和

stdout stderr pbs qsub

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pbs 作业忙时无输出

我在使用 PBS 时遇到了一个问题，在我提交的所有作业中，往往有一小部分无法产生应有的任何输出。我必须重新提交几次，直到他们...

cluster-computing pbs qsub torque

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如何获取max_array_size？

我正在尝试将大型作业数组提交到集群。 qsub 请求失败，并出现错误作业数组请求错误。我想这是因为我的工作数组太大了。我怎样才能读取最大允许...

hpc pbs qsub torque

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SGE 批处理文件未读取 .bashrc 和 conda 命令未找到

我有多个 conda 环境运行良好。当我尝试使用 qsub 将作业提交到 SGE 时，未读取 .bashrc 文件。批处理脚本如下所示： #!/bin/庆典 #$-cwd #$ -l h_cpu=48:00:00 #$-l

bash conda cluster-computing jobs qsub

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在Bash中循环以在目录中创建文件列表

我正在尝试获取一个目录中所有文件名的列表，但是由于某种原因，它不起作用。这是代码：*中的f做echo $ f >> summary.txt done您知道我在做什么吗...

bash loops qsub

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在群集的节点上启动Jupyter笔记本计算机（高性能计算或HPC设备）

我想在集群的节点上而不是登录节点上运行jupyter notebook。我可以在登录节点上远程运行jupyter笔记本，但这会不必要地减慢群集的使用。 ...

jupyter-notebook cluster-computing hpc pbs qsub

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SGE：在批处理提交（qsub）中运行一次交流会话（qrsh）

我正在尝试在SGE中运行一个简单的代码。但是，从交互式会话（qrsh）或通过qsub运行时，从同一代码获得的结果截然不同。大多数代码无法从qsub ...

qsub sungridengine

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如何直接通过qsub传递命令行程序？ [关闭]

bash qsub command-line-tool

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在bash上重复执行命令，直到满足条件为止

我有权访问100个节点。将作业提交给所有100个节点后，我想在180秒的睡眠时间后进行查询以找出队列中还有多少作业。如果有...

bash parallel-processing qsub

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PBS上的qsub没有给出输出

我正在尝试将python作业提交给PBS，并获得打印的内容作为输出。一个简单的例子是：python文件test.py：导入时间print（time.time（））pbs提交文件job_test.pbs：＃！/ bin / ...

pbs qsub

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从sge下的qsub命令中排除节点

我有200多个工作需要提交到sge集群。我将把它们分为两个问题。其中一位专家有一个我不想向其提交作业的机器。如何排除那台机器？...

nodes qsub sungridengine

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Qsub - 延迟/惊人的工作从一个工作阵列开始

可以通过qsub延迟或错开通过作业数组启动的作业的开始，例如， qsub -t1-4 launch.pbs？我可以通过在我的pbs中为一小段但随机的时间睡觉来做到这一点......

cluster-computing qsub

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使用anaconda环境运行qsub

我有一个程序通常在Linux中的conda环境中运行，因为我使用它来管理我的库，使用以下指令：source activate my_environment python hello_world.py我怎样才能......

python linux anaconda pbs qsub

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在PBS Pro中排除（或包含）特定节点

我正在研究一个有8个节点的集群; 4个节点有python，4个节点没有。如何确保我的python作业只用python转到节点？我对群集PBS Pro 13.1没有管理员权限...

cluster-computing pbs qsub

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Python，使用Popen提交qsub作业

我必须编写一个python脚本来使用qsub（SGE）提交作业。我想执行的命令是以下形式：qsub -b y / usr / bin / L2prod filein fileout其中L2prod是一个已编译的程序（...

python popen qsub

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如何在群集（qsub）中重新启动失败的PBS作业？

我正在使用qsub命令在集群中运行PBS作业（python）。我很想知道如何从失败的步骤中重新启动相同的工作？任何类型的帮助将受到高度赞赏。

python-3.x pbs qsub torque

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在SnakeMake中使用Conda环境解决SGE集群问题

相关：使用Python脚本，conda和集群的SnakeMake规则我一直在尝试设置我的SnakeMake管道以在SGE集群（qsub）上运行。使用安装的简单命令或工具......

python conda qsub sungridengine snakemake

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是否可以创建依赖于上下文的函数？

我已经使用以下脚本直接运行脚本，只是为了在脚本外部运行bash命令行（例如作业调度程序）。 def qsubcommand（func）：def wrapper（* args，* ...

python decorator qsub

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如何在作业数组中qsub bash脚本改变bash中存储在数组中的参数

我有一个脚本，我想用几个不同的参数执行，我有一个包含所有参数（参数）组合$ {array [i]}的数组。我希望能够提交一份工作数组......

arrays bash jobs qsub

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