slurm 相关问题

SLURM是一个开源资源管理器,专为各种规模的Linux集群而设计。

如何在阵列作业中使用所有逻辑处理器?

我正在尝试在 slurm 中运行一个包含 2700 个任务的数组作业。我使用的计算机有 48 个物理核心和 96 个逻辑核心。然而,当我运行我的脚本时,每个任务都与 2 个 CPU 相关联,安装...

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由于 cgroup.conf 解析错误,SLURM slurmd 服务无法在 Raspberry Pi 5 集群上启动

我有一个 Raspberry Pi 5 集群,设置了一个主节点和一个工作节点。我在主节点上成功安装了 SLURM,目前我正在尝试将 slurmd 守护进程配置为在

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如何指定输入名称为 000 到 999 的 slurm 作业数组

我使用 split -a 3 命令生成了输入文件,以便将它们称为 输入_000.txt 输入_001.txt ... 输入_999.txt 但是,当使用 sbatch --array=000-999, 000 自动提交时

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在 DeepSpeed 和 Hugging Face Transformer 中加载预训练模型和文件锁定的问题

我目前正在开发一个涉及 MobileVLM 模型的项目,使用 Hugging Face Transformers 库来加载预训练模型。我在 SLURM c 上运行脚本时遇到问题...

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Slurmd 无法启动并出现以下错误: fatal: 无法确定此 slurmd 的 NodeName

我正在尝试在一堆 aws 实例上设置 slurm,但是每当我尝试启动头节点时,它都会出现以下错误: fatal:无法确定此 slurmd 的 NodeName 我已经设置了

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如何优化 SLURM 脚本,以便为大型预训练网络和使用 PyTorch 的模型使用更多 GPU?

我们学校有一台带有多个 GPU 的 HPC,我正在尝试找出如何利用更多 GPU 来更快地运行我的代码,但是我在批量大小 128 时不断遇到此错误: 追溯(最推荐...

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不可能的CPU核心/线程配置

我正在尝试设置 slurmd 的测试实例,但似乎无法让它接受我的 CPU。 这是 lscpu 的输出: 架构:x86_64 CPU 操作模式:32 位、64 位 一个...

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Slurm - 如何自动将 --mail-user 设置为当前用户?

我有一个 SLURM 文件,例如 #!/bin/bash #SBATCH -n 1 # 两个核心 #SBATCH --mem=1G # 内存 #SBATCH --time=01:99:99 # 总运行时间限制 (HH:MM:SS) #SBATCH --邮件-

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无法从 slurm REST API 提交 GRES 值

我一直在尝试通过 REST API 提交 slurm GRES 标志,但是,我找不到通过 REST API 执行相同操作的方法。我使用的是解析器版本0.0.40 这难道不是……

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使R代码(dada2包)在HPC计算机上多线程运行(通过slurm提交)

我的 R 代码无法在 HPC 集群上并行运行,我不明白为什么。根据dada2文档,如果为multithreaded = #标志指定了一个整数,它将被传递给

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使用带换行的替换符号进行slurm

我使用 --wrap 选项向 slurm 提交一个脚本,但我也希望它向日志文件添加运行时间。 批\ -J 名义 \ --mem=16G \ -c 4 \ -t 24:00:00 \ -p

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显示帐户所有成员的使用情况的 SLURM 命令是什么?

我尝试了“sacct -A ----allusers format=User,JobID,CPUTime,MaxRSS,Elapsed” 然而,它显示了该帐户的每个用户的每个作业的资源使用情况,而我...

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使用 slurm 阵列作业

我有一个作业脚本,它运行某个 python 脚本,并使用 argparsing 提供的参数。我知道当我想要运行这项工作时,我几乎总是想要提交不仅仅是一项工作,而是七项......

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如何在NextFlow中自定义执行器

我修改了Slurm指令,但是nextflow中有一个默认的SlurmExecutor,我可能需要修改或覆盖SlurmExecutor。 使用IDEA maven,不知道@Generate用的是什么工具

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与 HPC/Slurm 交互工作时将 VS Code 终端附加到 R 脚本

我通过 VS Code Web 连接到 HPC 集群。然后,我使用 salloc 请求资源,然后可以使用 srun 或 ssh 启动交互式会话,如此 SO 响应中所述。 哈...

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SLURM 执行器插件错误:SLURM 会计已禁用

我正在尝试使用snakemake版本8+提供的slurm执行器插件运行5个静态节点并行集群snakemake工作流程。 我开发了我的 Snakefile 并使用以下命令......

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使用 slurmdbd 进行 Slurm 会计

我设置了一个 slurm 测试集群并想要启用记账。我可以提交并运行作业。但是 sacct 返回一个空表。我的 slurm_acct_db 数据库中的表 cluster_job_table 是空的...

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使用 sbatch 提交作业时保存 slurm 作业 ID

有没有办法用 sbatch 提交作业到 slurm 并将作业 id 记录到变量中? job_id = sbatch --account my_account some_script.sh 回显$job_id 17210254

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在多个 slurm 文件中的一个节点上启动多个作业

我想使用 slurm 告诉服务器它可以在每个节点上放置多个作业(直到最大或直到给定阈值)。我想为每个作业使用一个 slurm 文件(和一个 sbatch 命令)来完成此操作。埃夫...

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有什么方法可以让slurm报告任务重启次数,或者只报告作业重启次数?

我正在运行一个包含许多任务的 slurm 阵列作业。每个任务都可能失败并重新启动,并且每个任务需要知道它已经重新启动了多少次。我希望环境变量

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