h5py 相关问题

h5py是一个与NumPy兼容的Python模块,用于处理分层数据格式(HDF5)文件。

如何从文件名中获取信息,并将其分成几部分以保存在列表中

我需要采用这段代码并将其转换为一个函数,该函数将从目录中.h5文件的文件名中获取信息。我对python很陌生,所以希望我的解释在这里...

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HDF5数据集只存储0 /空值

我正在将CSV文件写入HDF5文件,以便在不占用内存的情况下以更好的方式加载信息。我的CSV文件包含一些索引,我正在通过...

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Python for hdf5文件中非数字文件夹的循环

我想从.HDF5数据文件中提取数字,该文件位于数字递增的文件夹中:Folder_001,Folder_002,Folder_003,... Folder_100。在每个文件夹中,我要提取的数据具有相同的...

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h5py文件与pickle文件在保存模型时的区别

我想清楚地了解模型保存。神经网络中有超参数和模型。训练模型后,我想保存所有它们以使用它们而无需重新训练模型。当我...

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将hdf5附加到另一个hdf5文件中

我有几个具有相同形状的hdf5文件,其中包含x和y列。我需要附加这些文件,以获得一个包含所有数据的hdf5文件。到目前为止我的代码:def append_to_h5(new_file,...

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如何从HDF文件提取数据?

我有一个HDF文件(.h5),它具有以下层次结构,我从未使用过这种数据。我认为“条形码”应该是我的列,“功能/名称”应该是我的行,“数据” ...

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Iterator类无法对用h5py打开的HDF5数据引发StopIteration

我正在尝试为h5数据集实现一个可迭代的类。 class Argh():def __init __(self,data):self.data =数据self.c_idx = 0 def __getitem __(self,idx):...

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HDF5到CSV转换期间出现多个错误

我有一个巨大的h5文件,需要将每个数据集提取到一个单独的csv文件中。模式类似于/ Genotypes / GroupN / SubGroupN /具有“ N”个组和“ N”个子组的调用。我已经创建了...

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由于h5py,无法通过命令提示符加载keras模型

我一直试图在.py脚本中使用h5 Keras模型使预测自动化,并使其通过Windows Task Scheduler运行。当我在anaconda jupyter笔记本上编写脚本时,脚本就消失了...

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如何为H5配置maxshape参数并追加到文件?

我正在尝试将图像数据集合并为H5文件。到目前为止,我已经设法创建了文件,但是当我追加文件时,它只会覆盖已经存在的文件。我看过其他答案(例如...

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如何创建空引用/取消设置引用?

考虑一下我有一个引用数据集f = h5py.File(“ test.h5”,“ a”)d = f.create_dataset(“ refs”,(10,),h5py.ref_dtype)d [0]#< [我可以通过...创建非null引用,...

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是否可以将每个HDF5数据集保存为.csv列?

我正在努力使用H5文件来提取数据并将其保存为多列csv。如图所示,h5文件的结构由主要组(基因型,位置和分类单元)组成。主要群体,...

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[试图打开h5py中的熊猫创建的hdf时缺少列

这是我的数据框的外观。第一列是单个int。第二列是512个整数的单个列表。 IndexID ID 1899317 [0,47715,1757,9,38994,230,12,241,12228 ... 22861131 ...

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使用h5py过滤hdf5文件中的组

我有一个问题,我找到了一个不错的解决方案,并想知道是否有更好的方法可以做到这一点。 (使用python 3.6)我想将一组实验的结果存储在不同的...

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如何从保存的模型.h5访问激活功能?

是由model.save()生成的.h5文件中存储的每个层的激活函数吗?还是已经“融入”了砝码?我正在编写一个AWS Lambda函数以生成时间序列...

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如果dtype为“

我想从hdf5文件中获取格式为{N,16,512,128}的数据集作为4D numpy数组。 N是具有{16,512,128}格式的3D数组的数量。我尝试这样做:import os import sys import h5py as h5 ...

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是否可以从HDF5数据集中删除行?

我创建了一个H5PY数据集,大约有210万个实例。问题是我已经填满了除最后一行以外的所有行。我想删除最后一行,但是不确定......>

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使用AWS boto3读取h5文件

我正在尝试使用boto3从AWS S3读取h5文件。客户端= boto3.client('s3',key ='key')结果= client.get_object(Bucket ='bucket',Key ='file')和h5py.File(result ['Body'],'r')如f:data = ...

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在键值字符串的h5py数据集中缓慢的数据检索

给出以下h5py文件根-> group1->百万个键,值对:检索任意数量的数据集(甚至1个)都花费很长时间(〜10秒),我想知道是否可以插入它们...] >

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