h5py 相关问题

h5py是一个与NumPy兼容的Python模块,用于处理分层数据格式(HDF5)文件。

快速重复写入hdf5文件

不久前,我编写了并行的FORTRAN代码,该代码对角化超级计算机上的超大型密集矩阵。这些矩阵是从密集的hdf5数据集中读取的。现在我想将此代码用于...

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我应该如何使用h5py库存储时间序列数据?

我有一些时间序列数据,以前我使用pytables作为hdf5文件存储。我最近尝试用h5py lib存储相同的内容。但是,由于numpy数组的所有元素都必须具有相同的dtype,因此...

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“文件存在”在尝试使用h5py库在python中打开.mat文件时出现错误

我尝试使用以下代码访问.mat文件中的部分数据(称为“掩码”):import h5py import numpy as np g = h5py.File('/ Path / to / file.mat' )x = g [“ mask”] print(np.array(x))...

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在h5py中,我在关闭文件之前需要调用flush()吗?

在Python HDF5库h5py中,我需要在close()之前冲洗文件吗?还是关闭文件已经确保了缓冲区中仍可能存在的所有数据都将被写入磁盘? ...

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将压缩文件夹中的文件夹中的H5文件读入pandas数据框

我的目录结构如下所示:file.zip/2019/file.h5 file.zip是压缩文件夹2019是压缩文件夹内的文件夹,我可以使用extractall提取文件夹并阅读...

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用h5py增量写入hdf5

我有一个关于如何最好地使用python / h5py写入hdf5文件的问题。我有类似的数据:----------------------------------------- |时间点|电压1 |电压2 | ... -------------------...

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如何在hdf5文件python中保存提取的功能列表

我正在从音频文件中提取一些功能,并将其保存在列表中,然后将列表保存在hdf5文件中,但这会导致错误。以前我直接将功能保存在hdf5文件中,但它只是...

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Keras模型到tensforflow

是否可以将keras模型(网络架构和权重的h5文件)转换为张量流模型?还是有一个等效的函数来建模。在张量流中保存角膜吗?

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如何从已保存的预训练模型的h5文件中查找层数?

我有以h5格式保存的VGG-16权重。我想查看网络中的层数。我怎样才能做到这一点?我尝试使用:file = h5py.File(vgg16.h5)之后,我检查了file.attrs但...

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计算内插后的3D规则网格数据的导数

我的数据是一个普通的3D网格和作为一个最简单的例子我这里给出一个简单的H5文件的代码,一个简单的立方体和我用RegularGridInterpolator功能进行插值。但是,我想知道......

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如何调整的HDF5数组`h5py`

我如何可以调整使用h5py Python库的HDF5数组?我已经使用.resize方法,并设置为True块阵列上的尝试。唉,我还是失去了一些东西。在[1]:进口h5py ...

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结合hdf5文件

我有许多hdf5文件,每个文件都有一个数据集。数据集太大而无法容纳在RAM中。我想将这些文件组合成一个单独包含所有数据集的文件...

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Python:使用h5py和NumPy从MATLAB .mat文件中读取str

我很难将'str'变量'Et'(Endtime)和'St'(Starttime)从MATLAB .mat文件加载到Python中。我想要与MATLAB中相同的输出。相反,我有问题试图......

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将h5py文件上载到aws并再次下载

我无法找到一个明确的解决方案,所以希望这个问题在将来对其他人有用。基本上我正在创建一个h5py对象,如下所示:keys_d = [matrix_l2T.data,...

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为什么我在for循环的第一次迭代后得到此错误(TypeError:'_ io.TextIOWrapper'对象不可订阅)?

我编写的以下代码将运行一次迭代,没有任何问题。但是我希望它循环遍历x的所有值(在这种情况下有8个)。在完成第一次循环之后,......

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如何在不覆盖的情况下编写hdf5文件?

很抱歉,这是关于h5py的一个非常基本的问题。我正在阅读文档,但我没有找到类似的例子。我正在尝试用Python创建多个hdf5数据集,但事实证明......

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将ROOT树转换为HDF5

我在ROOT中有一个TTree,其中包含1000个事件和15个变量。我想将其全部转换为hdf5数据集。如何在HDF5组中组织我的数据,以便......

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将hdf5文件加载到python xarrays中

python模块xarray非常支持加载/映射netCDF文件,甚至懒惰地使用dask。我必须使用的数据源是数千个hdf5文件,包含许多组,数据集,......

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无法修改较大数据集中的项目

我的数据集由多维矩阵数组成。我试图改变其中一个矩阵的值,但是我写的代码即使在我重新分配后仍然显示旧值...

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有没有办法在使用Group.visititems时获取数据集或组的父级?

我试图将一个h5py File对象放入一个树结构中,以便我可以使用它的能力打印出一个树的表示,以与linux“tree”相同的方式显示文件的内容......

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