nlme 相关问题

用于拟合非线性混合效应统计模型的R包。

nlme 对象上的 tbl_regression

有人可以帮我弄清楚如何在这个 nlme::lme 模型上使用 tbl_regression 吗? 我使用 dplyr 的风暴数据集做了这个例子...... 这是我到目前为止所尝试过的: 头(风暴) 风暴_lme &...

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R(lme)和SAS(proc mix)中线性混合模型的不同结果

我尝试使用nlme包中的lme函数来拟合随机系数模型,示例代码如下: 模型_示例 <- lme(CFB~ BASE + Dose + ADY + Dose:ADY + BASE:ADY,

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交叉设计中评估基因-代谢物关系的指南

我正在对交叉研究的数据进行二次分析。我的目标是确定怀疑在生成某种化学物质/代谢物中发挥作用的特定基因是否是积极的

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警告:忽略非列表对比参数

我正在使用 R 中的“mgcv”包运行 gamm: 附加.模型.饱和 <- gamm(log.titer ~ condition + Age_month_selective + Season.2 + ...

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R 中混合效应模型 (lme) 的 III 型方差分析对比

我正在 R 中使用 nlme 运行一系列混合效果模型。这是我的最终模型的示例: M1.决赛 <- lme(Response ~Treatment * Species, random = ~1|ID, data = data, method=&...

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循环创建多个lme模型,其中每一列都是不同的解释变量,并且还循环遍历年份(滚动窗口)

在外循环中,我为模型的固定效应创建一个公式,循环遍历列(每列都是一个独立变量)。 在内部循环中,我选择年份的子集......

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如何更改点阵中的图例文本颜色,使其与主题完美配合?

我想在深色主题的 IDE 中绘制图表并分析数据。我想也许我可以用主题包来完成这个任务,而且它大部分都有效,但我正在努力处理格子图。在最

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使用 nlme 和 SSasympOrig 将协变量添加到 R 中的渐近回归模型中

我有两组数据,并且有理由相信它们遵循相同的渐近曲线,且具有偏移上限。假设所有观察结果都是独立的。我用这个拟合了一个简单的模型...

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将 nlme 模型的拟合线添加到 ggplot,并包括置信区间

我使用 nlme 对我的数据进行建模,如下所示: 图书馆(nlme) 我的模型<- lme(metric ~ group * time, random = "~1 | tech_rep", na.action = "na.omit", data = my_data) I then want to

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在 Mac 上找不到已安装的 gfortran 软件包

我正在运行 MacOS Ventura 13.6.7。我想使用RStudio安装nlme R包,这需要编译。当我尝试安装它时,出现以下错误: 安装源码包...

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预测数据的自举置信区间显示重叠,而固定效应则不然

注意:这可能更适合交叉验证,如果需要的话我可以将其移到那里,但我想我会先在这里尝试,因为它可能与 r 相关。 我正在比较生长曲线

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如何修改 lmer(Yield ~ Env + (Env | Name) 以获得每个 Env 级别的方差参数以及随机截取 Name 的方差

我使用 R 中 sommer 包中的数据集,其中 Env 是 3 个级别的因子,Name 也是一个因子。 图书馆(lme4) 图书馆(夏季) 数据(DT_示例) DT <- DT_example mod_a <- lmer...

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sommer 包相当于 lmer(反应 ~ 天数 + (天数 | 主题), 数据 = sleepstudy)

在 lme4 中,lmer(Reaction ~ Days + (Days | subject), data = sleepstudy) 指定一个线性混合模型,该模型具有主题的随机截距和天数的随机斜率,具有相关的随机截距和 r...

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使用 R 中的 lme() 使用混合模型预测新值

我有以下数据: str(增长数据) 小标题 [92 × 4] (S3: tbl_df/tbl/data.frame) $ 人:数字 [1:92] 1 1 1 1 2 2 2 2 3 3 ... $ 性别:chr [1:92]“F”“F”“F”...

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r 替换 lme S4 对象中的部分字符串

这个问题是关于如何从S4 lme模型摘要对象中删除部分字符串。 假设这是我的模型。 # ----预备工作-------------------------------------------- ------------ 图书馆...

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nlminb 问题,收敛错误代码 = 1 消息 = 达到迭代极限但未收敛 (10)

我正在尝试使用 R 中的库(nlme)和 lme 函数找到适合我的数据的最佳模型。这是当斜率固定时我的模型: 固定绳长 <- lme(EnergyCost~ RopeLength, data = ...

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使用非线性混合效应模型 (nlme) 的预测变量进行预测的置信区间

我正在尝试使用 Ben Bolker 描述的 bootstrap 方法为非线性混合效应模型生成 95% 的置信区间。我可能误解了所使用的一些功能。我...

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nlme 中的多种随机效果

我需要在我的 lme 模型中再包含一个随机效应。然而,这两个随机效应不相关,因此不能嵌套。 我不确定如何为此编写代码。我已经尝试过

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如何在 nlme 与 lme4 中指定不同的随机效果?

我想使用 nlme::lme (底部的数据)在模型中指定不同的随机效应。随机效应是: 1) 截距和位置随主体而变化; 2) 截距随比较而变化...

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以混合模型方法分析这些数据的正确方法是什么?

我对完全随机区组设计中的浪费率进行了实验,并评估了多年来的土壤肥力和树木高度/直径。哪个型号最适合这个d...

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