cluster-analysis 相关问题

聚类分析是将“相似”对象分组为称为“聚类”的组的过程,以及对这些结果的分析。

如何使用sklearn指定聚合聚类的内存目录

我正在尝试使用 sklearn 的 AgglomerativeClustering 来优化用于在同一数据集上计算具有不同数量的集群的多个结果的计算时间。 如 s 中所示...

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将行簇应用于新矩阵时,R ComplexHeatmap 无法重现精确的行顺序

我首先在 ComplexHeatmap 中使用 k-means 方法对矩阵的行进行聚类,然后将聚类应用到具有相同维度的新矩阵上,并且我预计我可以在...

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根据常见子模式对短的同质字符串(DNA)进行聚类并提取类的共识

任务: 将大量短 DNA 片段聚类到共享共同子序列模式的类别中,并找到每个类别的共有序列。 泳池:约。 300 个序列片段 8 - 20 让...

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K-means 递归:ConvergenceWarning:发现的不同簇数 (5) 小于 n_clusters (6)。可能是由于 X 中的重复点

我编写了一个Python脚本来使用聚类(K-means)获得TSP的解决方案。原理是创建集群并获取每个集群之间的最佳路径(使用它们的质心)。那么,对于...

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根据局部线性度分割一组点的分割算法

假设我有一些点,大致由 N 段组成,每个段之间都有一定的线性关系。下面的例子显示了3个簇,但一般我们不知道有多少个segm...

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使用 k 均值聚类在两个 Igraph 图之间通过颜色指示相同的聚类

我有来自两个不同数据集的两个邻接矩阵,它们具有相同的变量: 阿玛特<- read.table(text = " Si N1 N2 A1 A2 A3 A4 A5 Z1 Z2 Z3 Z5 Si 367 0 0 48 0 365 ...

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K-Means 聚类中距质心最近的 M 个点

我实现了一个函数,用于查找运行 K-Means 聚类算法后计算出的每个质心最近的数据点。我想知道是否有一个 sklearn 函数可以让我...

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内核自组织映射(SOM)中的归一化获胜频率是什么?

在 MacDonald 和 Fyfe (2000) 提出的基于 k 均值的内核 SOM 中,均值的更新基于软学习算法 mi(t + 1) = mi(t) + Λ[φ(x) − mi(t)] 其中 Λ 是归一化的 wi...

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识别受边缘属性约束的连接子网

我正在处理网络数据,想要识别连接的子网。我使用加载数据 图 <- graph_from_data_frame(filtered_df, directed = FALSE) and ploted my network plot(graph) E(

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在 scikit-learn 的凝聚聚类算法中,如何获得所有中间簇?

我正在运行这个相对简单的算法。 如果我正确地理解了算法,如果你聚类到 8 个簇,那么你应该得到 8 个以上的所有簇的结果,对吧? 会...

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基于亲和力矩阵的谱聚类

导入csv 将 numpy 导入为 np 从 sklearn.cluster 导入 SpectralClustering reader = csv.reader(open("/Users/Desktop/user2.csv","rU"), 方言=csv.excel_tab) ...

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我需要对两个甜甜圈形状数据集进行谱聚类。(Matlab)

我已经尝试了几个小时,但找不到解决方案。 我有“两个甜甜圈”数据样本(变量“X”) 您可以在下面的链接下载文件 甜甜圈数据集(rings.mat) 扩展到 2D 形状,如下图所示

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稀疏数据集上的谱聚类

我正在一个数据集上应用谱聚类(sklearn.cluster.SpectralClustering),该数据集具有相当多的相对稀疏的特征。在 Python 中进行谱聚类时,我得到以下结果

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使用 sklearn 和大亲和力矩阵进行谱聚类

我正在尝试使用 scikit-learn 提供的谱聚类方法来聚合我的数据集的行(只有 16000 行)。 在我预先计算亲和力矩阵(a

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随着聚类数量的增加,轮廓值也随之增加

我有一个矩阵,行是品牌,列是每个品牌的特征。 首先,我使用 scikit learn 计算亲和力矩阵,然后在

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在混合分类和数值数据的 k 原型聚类算法中运行轮廓分数计算速度很慢

我正在使用 k-prototyps 库来实现混合数字和数值数据类型。根据 https://github.com/nicodv/kmodes/issues/46 为了计算 k 个原型中的轮廓分数,我计算了

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sklearn中可以使用余弦距离进行Kmeans聚类吗?

我想使用 Sentence Transoformer 中的 BERT 嵌入对我的文档进行聚类,尤其是 bert-base-nli-mean 标记,并且我想使用 kmeans 聚类对该嵌入进行聚类,但我有一个问题...

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类型错误:pyclustering 库中未调整大小的对象的 len()

我正在使用 pyclustering 库来执行 K 均值。我正在使用的数据集以 CSV 格式读取,如下面的代码所示。我尝试过将 X_scaled 作为 numpy 数组传递,作为我们的列表......

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如何使用 rgeoda 将 R 中的纬度/经度点聚类为恰好 5 个最近邻的组?

我正在努力根据学校之间的距离将学校聚集在一起。出于政策(预算)原因,我们希望这些组中尽可能多地包含 5 所学校。我们有...

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cdlib和igraph的variation_of_information结果不同

假设我们有两个社区分区,如下所示: 社区分区1 社区0= [8, 16, 17, 19, 20, 21, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33] 社区 1= [1, 2, 3, 7, 11, 12, 13, 15, 18]

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