分层聚类是一种聚类技术,可在多个层级生成聚类,从而生成聚类树。分层聚类为具有可视化潜力的分析师提供了优势。
我正在使用R heatmaply包来生成交互式热图。我喜欢该软件,但是我想从中获得与使用pheatmap相同的聚类(行和列的顺序)...
[我根据spearman的相关矩阵创建了一个热图,并使用了Seaborn簇图,如下所示:sns.set(font_scale = 1)g = sns.clustermap(df,cmap =“ bwr”,vmin = -1,vmax = 1,.. 。
我对OPTICS算法感到困惑。如果一组点是密度连接的,则可以将它们视为一个群集。如果存在对象o,使得...
如何在Seaborn / Matplotlib上获得带注释的热图/集群图?
我正在处理一堆患者的肿瘤图像表达数据,对于每个患者,我都有其肿瘤的提取图像特征列表。我使用...
为什么scipy.cluster.hierarchy.linkage需要度量?
我们需要传递距离矩阵,因此不需要计算任何其他距离,对吗?我想念什么?此处的文档:http://docs.scipy.org/doc/scipy-0.14.0 / ...
我为我的数据集生成了一个树状图,但我不满意如何在某些级别对拆分进行排序。因此,我正在寻找一种交换单个拆分的两个分支(或叶子)的方法。如果...
我正在尝试使用python查看/编写用于分层集群的代码。但是,在我看来,到处都在使用软件包或库,例如scikit-learn。我想看一下...
我拥有大量数据,且协变量超过10个。目前,我正在使用分层群集。在树状图上,我看不清标签,因为标签太多了。 -是否有...
我对python和杂乱无章的东西很陌生。现在,我的任务是分析一组数据,并使用弯头和轮廓法确定最佳Kmean。如图所示,我的...
我如何找出损失的样本数>损失中位数;以及使用R中的层次聚类造成的损失。我正在使用数据集Allstate声明严重性,我认为数字...
我是R和(无监督)机器学习的新手。我正在尝试为R中的数据找到最佳的群集解决方案。我的数据是关于什么的?我有一个+/- 800长/纬度WGS84的数据集...
#绘制图形plt.figure(1); plt.clf(); plt.scatter(data [0,:],data [1 ,:]); plt.xlabel('x'); plt.ylabel('y'); plt.title(“来自CURE数据集的所有点的图”)#进行树状图Y = pdist(data,'...
我是新手,需要绘制具有组平均链接的树状图。我知道在create_dendrogram()中有一个distfun参数,但是我不知道该如何传递给...
我已经根据纬度和经度距离对数据集进行了聚类,并使用了cutree函数来确定每个唯一的纬度和经度所属的聚类。我的输出显示在这里。 ...
在此分层聚集群集代码中,我试图将每个群集的值放在单独的列中。我的数据集如下所示:19.9884 19.9884 19.3024 19.3024 18.3420 18 ....
我正在尝试标记scipy.cluster.hierarchy.dendrogram生成的树状图中的节点。我正在使用此处建议的增强树状图,试图替换集群间距离...
[我有一个数据库,我使用(agnes())进行了层次集群,并且运行良好(我按以下说明进行了工作:https://uc-r.github.io/hc_clustering。现在我想比较人造集群或...
我有一个点矩阵,我想手动聚类(不带函数)。 > X =矩阵(c(9,7,1,8,1,5,6,1,7,9,1,1,7,5,4),nrow = 2,ncol = 7,byrow = TRUE)>打印(X)...
我有一个简单的距离矩阵,例如:我尝试制作自己的距离矩阵:distances = matrix(c(0,6.32,11.3,1,10,5.66,4.24,6.32,0,6.32,6.08,6,2.83 ,...